По заземлению ПК - металлический ящик, в нем решетка внутри решетки диэлектрик, внутри ПК, ящик подсоединить к контуру заземления с сопр 4-6 Ом, к этому контуру не цеплять никаких других устройств, нулей и проч.
По хранению БД: думаю лучше разделить всю инфу на CD (им точно пофиг ЭМ излучение), флэшки, НЖМД, каждое устройство завернуть в пакетик от материнской платы или прочей компьютерной фигни в виде фольги с сеточкой (так компании защищают от ЭМИ свой товар при транспортировке) и в ящик.
В виде считывающего устройства подойдет я думаю нетбук, с минимальным объемом ЖД - 3-5 т.р.(у вас же будут флэшки и CD) и тоже в ящик, и раз в месяц/квартал/год обновлять базы.
При выходе из строя считывающего устройства можно найти другое.
И военные имеют ПК с защитой от ЭМИ))))